Здравствуйте.
>Как можно удалять уже выученные слова из списков "Слова на изучении"
Если слово находится в списке "Слова на изучении" значит оно ещё не считается выученным. Принудительно перевести слово в список выученных можно нажатием на крестик в упражнениях, в то время когда это слово появиться у вас в упражнении. Либо же пройти все уровни изучения и тогда система сама присвоит ему статус "выученное".
>и из списка в левом углу при поиске, чтобы не отвлекали
Пока никак, в будущем, думаю появиться такая возможность.