Можно, для этого Вам необходимо:
1. создать дубликат темы для каждого из приложений (вкладка "дизайн" каждого из приложений - страница "настройки" - ссылка "создать дубликат")
2. для дубликата темы приложения "сайт" создать уникальный идентификатор - "ID темы" (вкладка "дизайн" приложения "сайт" - страница "настройки" - ссылка "переименовать")
3. для дубликатов тем других приложений, сменить "родительскую тему" (вкладка "дизайн" каждого из приложений - страница "настройки" - ссылка "Родительская тема ... сменить"), на id дубликата темы приложения "сайт"