Выполнено в версии 2015.04.
МЕНЮ - Буфер. Таким образом можно обмениваться данными с другими приложениями (например chess.com). Вставка всегда осуществляется в текущую партию.
В ChessBase и в Chess Assistant для винды можно маркировать поля 3-мя цветами (желтым, зеленым и красным) и стрелочки рисовать этими же цветами.
Пример PGN: http://chess4you.ru/files/pgn-demo/demo.zip