Вынести доступ к настройкам SIP в меню приложения Телефон можно.
Остальное не понял (может быть потому, что SIP никогда не пользовался и в глаза его не видел).
Что имеется ввиду под:
1. Выбор с чего звонить. Сейчас можно выбрать СИМ-карту для звонка. Это не то?
2. О каких значках речь? Сейчас есть значки отображающие входящие, исходящие, пропущенные звонки. Это не то?