В официальном клиенте, когда разворачиваешь уведомление о сообщении на экране блокировки, имеются опции "Ответить" и "Прочитано". Можно ответить, а можно сразу пометить как прочитанное, и даже телефон разблокировать для этого...
Официальный ответ
thest, 20.06.2018
Добавили кнопку Прочитано в уведомлении о новом сообщении. Можете проверить в свежей тестовой версии http://katemobile.ru/dl/test/Kate.apk