Исправлено. Скорее всего дело было в ограничении выполнения скрипта который отдаёт файл, чтобы его можно было обзывать нормальным именем, а не цеферками.
Сейчас снял ограничение на время исполнения. Должно всё хорошо скачиваться. У меня по крайней мере всё ок.