В любом случае карта даёт полную свободу действий в расположении блоков и установке связей между ними. То насколько упорядочена ваша карта зависит только от вас. Размещайте блоки так чтобы линия связи между ними шла простейшим путём, не создавайте лишних пересечений связей. Любую связь можно открепить и прицепить более правильно к нужной стороне блока. Любую связь можно удалить и нарисовать заново. Карта будет в порядке ровно настолько насколько есть порядок в вашей голове.
