Здравствуйте!
Архивирование / перемещение писем между папками планируется к реализации. Возможность отключать цепочки писем то же планируется, но позже.
Если вы просто установили метку на письмо (отметили его звёздочкой), а затем решили его удалить, то логично, что такое письмо должно быть удалено в Корзину, с которой, при необходимости, вы можете восстановить удалённое письмо.