Вы можете установить Бота в несколько папок - в каждой из них будут свои настройки программы, анкеты, задания. Бот портабельный, все данные в папке с ним. На всех тарифах кроме безлимитного можно запускать только одного Бота, поэтому просто по очереди работайте с каждой папкой.
