LP-LinkPopularity рассчитывается по формуле А.Садовского (http://digits.ru/articles/promotion/pagerank.html)
и как вы верно поняли характеризует распределение ссылочного веса по сайту(относительно главной страницы). В PageWeight рассчитывают (относительно PageRank каждой страницы) и слегка по другой формуле. Но у этой формулы есть минусы так как на новых сайтах нет PR. Также точное значение PR в реальном времени получить не возможно.