Можно в приложениях вконтакте использовать фреймы - тогда не надо особо заморачиваться о интеграции - пользователи просто увидят интернет-магазин в окошке.
Все настроено и делается автоматически. Кроме того выгружаются товары в каталог товаров вконтакте и добавлена кнопка мне нравится, оплата деньгами вконтакте.