Размещать пин (булавку) остановки можно максимум в 60 метрах от самого значка остановки.
Из-за неточности схем Google, порой это расстояние больше.
Поэтому и получаются отростки.
Пока что это ограничение снято не будет, так как в этом случае в траектории возникают ошибки.